血吸虫病的治疗一般分为病原治疗和对症治疗。病原治疗最常用的药物是吡喹酮：急性血吸虫病一般是总量按120mg/kg，于2-3天内分次服完，其中50%必须在前2天服完。超过60kg的体重仍然按60kg计算。慢性血吸虫病成人吃吡喹酮总量按60mg/kg，2天内分4次服完。儿童体重在30kg以内的，总量可按70mg/kg计算30kg以上者与成人剂量相同。晚期血吸虫病一般总量可以按40-60mg/kg，2天内服完，每日分2-3次。年老体弱，有其他并发症者，可按总量60mg/kg，3天内分次服完。感染严重者可按总量90mg/kg，分6天内服完。
青蒿素及其衍生物是我国的发明，可在接触疫水后7-10天开始口服青蒿琥酯，剂量为6mg/kg，顿服，体重超过50kg者，按50kg计算，以后每周一次，离开疫区后再加服1次。最后就是注意对症处理。
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