小儿病毒性心肌炎的治疗是综合的治疗：
第一，是休息，减轻心脏的负荷，减少心肌的氧耗量非常重要，急性期最好卧床休息三到四周，如果出现了心功能不全、心脏扩大这些重症，要求绝对的卧床休息三个月，恢复期也要避免剧烈的运动；
第二，抗病毒的治疗；
第三，心肌炎的治疗主要是心肌营养及代谢药物的应用，目前临床上应用比较多的是大剂量的维生素C，可以口服，也可以静脉应用，它的机制主要是清除自由基，可以改善心肌的代谢，减轻一些症状，纠正心源性的休克，辅酶Q10可以改善心肌的收缩力，保护缺血性的心肌，
1,6-二磷酸果糖（FDP）可以抑制氧自由基的生成，减轻组织损伤，保护心肌，磷酸激酶也是直接提供了能量，改善心肌代谢，这是临床应用比较多的营养代谢的药物。免疫抑制剂一般病例是不需要应用的，主要应用于暴发性心肌炎，有心力衰竭、有心源性的休克、有恶性心律失常、高度的房室传导阻滞、室速、室颤这些严重的心律失常的患儿。
现在临床上还有些病例需要应用大剂量的丙种球蛋白，主要也是针对一些急性期病毒性的心肌炎，针对重症的、心衰的、心源性休克的高危病人效果很好，一般是按每公斤体重两克，两到三天之内应用完成。对症治疗主要是针对症状比较重的病人，临床心衰比较重的一定要积极控制心衰，抢救心源性的休克，需要应用一些血管活性的药物，临床常用的有多巴胺、多巴酚丁胺、米力农，加强心肌的收缩力，维持血压，改善微循环。
恶性的心律失常需要应用抗心律失常的药物，室上性心动过速临床应用腺苷治疗，如果血流动力学不稳定，可能需要电转复，室性的心律失常胺碘酮的应用临床上比较常见，还有一些病人也只是偶发早搏，可能不需要抗心律失常药物的治疗，但是如果出现了三度房室传导阻滞，有阿-斯综合征发作，可能需要安装临时起搏器。
另外还有中医中药，黄芪、麦冬、人参这些中药对于免疫功能的调节，抗病毒，营养心肌也有一定的作用。
所有的药物治疗一定要是在医生的指导下，根据病人的个体差异，根据病情，来决定治疗的方案。
总体来说，大多数小儿病毒性心肌炎的预后是良好的，少数可以转化为扩张型的心肌病，针对新生儿病毒性的心肌炎，一般来说临床是比较重的，这类病人需要特殊重视。
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