文昌鱼不是鱼类，它是一种脊索动物，又称为“蛞蝓鱼”，体长约50 mm，它是无脊椎动物进化到脊椎动物的过渡种类。文昌鱼的外形酷似小鱼，常成群生活在温暖的海洋中，寿命约2年8个月左右。每年的5～7月是文昌鱼的生殖季节，这种鱼的一生中可繁殖3次，其中最后一次产卵的数量最多。
文昌鱼为雌雄异体，通常会在6～7月产卵，它的生殖腺附生于围鳃腔两侧的内壁上，是26对左右厚壁的矩形小囊，性成熟时可根据文昌鱼的精巢为白色或卵巢呈现淡黄色进行雌雄鉴别。
文昌鱼在水中时，它会把半截下身埋在沙中，仅露出前半身在沙外，它主要依赖水流带来浮游生物、硅藻、植物为食，这种被动式的摄食方式，说明它属于非常低级的脊椎动物。
文昌鱼作为脊索动物门头索动物亚门幸存物种，是无脊椎动物演化至脊椎动物过渡典型的活标本。自1774年Pallas发现文昌鱼以来，它一直受到动物学界重视，是研究包括人类在内的脊椎动物起源与进化的极其珍贵的模式动物。
文昌鱼在世界各地的分布数量一般不大，唯有在中国沿海分布较广，但由于栖息环境遭到破坏等原因，文昌鱼的资源量逐年下降，分布区域变得越来越狭窄，已沦为稀少物种，我国已把文昌鱼列为二级保护动物。
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