武汉肺炎病毒最初来源于中间宿主，都是野生动物，是人吃了野生动物而得病传染人的。
从武汉市不明肺炎患者下呼吸道分离出的冠状病毒，它是一种属于β属的新型冠状病毒，有包膜颗粒呈圆形或椭圆形，多为多形性，直径达60~140纳米，与基因特征与SARS和MERS有明显区别。
目前研究显示，与蝙蝠SARS样冠状病毒同源性达85%以上。
野生动物可能是蝙蝠，是此次肺炎的原因，是由蝙蝠直接传播还是中间宿主传播人需要进一步的确认，它将有助于确定人畜共患模式传播的模式。
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