需氧菌的种类繁多，如B族链球菌、葡萄球菌、大肠埃希菌及肠球菌等都属于需氧菌，不同的需氧菌引起的感染应选用不同的抗生素进行治疗，所以不能说需氧菌感染就一概而论首选某种药物 。
大多数常见的需氧菌感染可以用喹诺酮类抗生素以及头孢类抗生素、β~内酰胺类抗生素等进行治疗，至于具体的用药还需要做细菌培养和药敏实验来选择敏感的抗生素。
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