功能转型所需政策配套 中国保税区发展出现功能错位的一个重要原因，是由于发展自由贸易港区的政策和管理体制尚未建立。为了支持保税区向自由贸易港区转型，中国不仅要调整现有的保税区政策，还要制定一些新的支持性政策。
一、出口退税政策。目前，国内非保税区的货物进入保税区时不予退税，必须当货物离境时才能获得出口退税。在出口加工区和其它保税仓库都已实施了进区（库）即退税的情况下，进入保税区的货物却不能实施出口退税政策，使得保税区失去了出口货物保税仓储场所的吸引力。政策调整方向是国内货物进入保税区视同出口，应该享受退税的货物，凭出口报关单、外汇核销单、增值税发票等单据即可办理出口退税手段，不必等到货物离境时办理。
二、贸易权。 1、进出口经营活动权。由于商务部将保税区内企业视同境外企业，保税区内企业一般没有外贸经营权。保税区内企业，特别是外资贸易公司，要开展进出口业务，必须通过有进出口经营权的外贸公司进行，增加了区内企业的经营成本，使商业交易复杂化。应赋予保税区内企业进出口经营权，放开区内加工企业的进出口经营权，允许外资贸易公司在从事转口贸易的同时有条件地开展国内进出口贸易。现在已经可以看到政策调整的趋势，从2003年开始，商务部开始对上海、深圳等4个保税区内的企业试点开放进出口经营权。 2、服务贸易。虽然国务院1995年已明确上海外高桥保税区可作试点，但是相应审批权限均在国务院各部委，未明确下放审批权限，也没有配套政策和管理规定，缺乏可操作性。相比之下，中国加入WTO后，保税区外的服务贸易开放步伐在加快。国家应当在保税区放开服务贸易的审批权限，营建商品展示中心，吸引国际跨国公司和综合商社进驻保税区，推动区内国际租赁、国际航运、国际法律服务、国际商品展示等服务贸易的开展。三、金融外汇管理政策。2002年10月开始施行的《保税区外汇管理办法》，为保税区内企业开展正常的经营活动创造了条件，但进口付汇方面的一些规定仍比较严格，这虽然有助于减少偷逃汇现象，但给区内企业增加许多不便之处，有些甚至限制了企业正常的经营活动，主要表现为：对购汇条件限制严格，基本上不允许购汇支付，以人民币注册成立的企业购汇支付额度不得超过其注册资本中实际到位的人民币投资部分；支付手续严格，如区内企业从境外进口货物销售给区外企业，由区外企业向境外支付外汇时，必须持区外企业进口报关单，但事实上许多区外企业会将货物先存放在保税区以享受延迟纳税的好处，而不办理进口报关手续，这时区内企业就不能向境外支付。 政策调整的方向应该是：经常项目下的支付应该完全放开，区内经常项目下货币可自由兑换。在外汇监管方式上，外汇管理局应该将主要精力集中于监管商业银行，由商业银行在为企业办理结售汇的同时，监管企业的外汇业务活动。以促进生产与流通，进出口贸易与转口贸易的结合。四、物流行业准入政策。物流行业是个新兴的综合性行业，涉及货运代理、集装箱运输、铁路货运、公路货运、航空运输、仓储等行业。目前，这些行业领域由不同的政府部门主管，各部门有不同的行业准入标准，特别是对于外商投资大多有一定的限制措施。因此，若想开展综合性的物流服务，企业必须向不同主管部门申领开业许可证，手续相当繁复。 如果缺乏大型物流企业，将会限制中国保税区向自由贸易港区的功能转型和发展。所以，政策调整的方向可包括：对于在保税区或自由贸易港区设立物流企业，审批上应该实行鼓励性政策，简化审批手续。并允许外商投资提早进入保税区或自由贸易港区的物流服务业。五、通关、检验手续和运输监管政策。中国的保税区虽然都是临港而建，但大多与港区分离，在管理上两者也分属不同部门，货物进出港口和保税区要经过二次海关通关。对于拼箱运输的管理，在很大程度上限制了区内企业开展物流运输服务。因为物流企业根据客户要求和成本核算，会将存放在不同保税区（或同一保税区不同仓库内）的货物、在不同时间运抵保税区的货物、不同供货商的货物、以及进口仓库与出口仓库货物进行拼箱运输操作。现行的海关规定中，虽然没有明文禁止上述业务操作，但由于海关监管时要求多种单据必须核对一致，使得拼箱运输事实上难以进行，阻碍了货物便捷畅通的流动。 政策调整的方向应包括：连通保税区和港区，实行区港统一监管，避免二次通关的重复手续。当因为区内企业的简单加工和运输作业而使货物的形态、数量、税号等性质发生改变时，海关在监管中可以有针对性地核对备案记录，不要求必须一致，只要基本对应即可。在仓储展示方面，允许除禁止及限制流通货物以外的商品均可进入保税区仓储、展示，有关税、费给予减免优惠，以区别于口岸和非保税区。将保税区明确定性为“境内关外”，逐步向“一线放开、二线管住、区内不干预”监管模式过渡，向自由贸易区转型。保税区的发展模式要求它必须在通关、物流、外汇金融等方面采取更加灵活和开放的措施。现在，通关不畅、优势削弱已经成为保税区面临的共同难题。只有转型为自由贸易区或者是单纯的经济开发区，才能保证这一特殊经济区域的不断发展。
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