大多数格林巴利综合征患者可以治愈，格林巴利综合征病情一般在两周左右达到高峰，持续数天，到数周后开始恢复，少数患者在病情恢复过程中会出现波动，多数患者神经功能在数周到数月内可全部恢复，少数患者会遗留持久的神经功能障碍。
格林巴利综合征病死率约为3%，主要死于呼吸衰竭、感染、低血压、严重心律失常等并发症。格林巴利综合征在急性期，可使用免疫抑制剂治疗，急性期患者如无免疫球蛋白过敏或先天性IgA缺乏症等禁忌症者，可首选静脉注射免疫球蛋白治疗，每公斤每天计算，连用五天为一个疗程。
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