黑魂3的故事发生在洛斯里克王国。玩家需要阻止由火之纪元和前代黑暗印记持有者之间的冲突造成的末世。为此，玩家需要去面对薪王，也就是那些曾经传过火的英雄。
《黑暗之魂3》的时代，火焰已经极其微弱。既定的薪王深知传火是条不归路，也不愿传火。而找不到合适的人去传火，只能把以前传过火的薪王从坟墓中唤醒，让他们再赴使命。但是这几个薪王中的三个也都不愿完成自己的职责。
深渊监视者们因为长期接触深渊的力量已经被其侵蚀，陷入了疯狂。他们不断自相残杀，无暇传火;艾尔德利奇预感到了火焰熄灭后的深海时代，在绝望中放弃了传火，并吞噬了很多人的性命，包括初代的神，变成了一堆腐烂物盘踞在初代王城里，迎接深海时代的到来;巨人尤姆因为当初没能守护自己的臣民免受火焰的伤害，都城被毁，陷入了深深的自责和悔恨，所以不愿有所作为。
最后，传火的重任就落到了玩家扮演的灰烬身上。
深处绝望的薪王们不可能靠劝说就自动归位，所以为了拿到薪王们的力量，玩家就必须在流程中突破重重守卫，杀死他们，将残存的柴薪取回。最后，当五大薪王的柴薪都归位到传火祭祀场的宝座上，灰烬将他们的力量都吸入了体内。
然后，灰烬前往初始的火炉，也就是初火所在之地，击败守卫在此的“薪王们的化身”之后就有足够的力量来传火了。根据选择的不同，剧情将会走向传火、灭火、篡火以及秘密四个结局。
像无数祖祖辈辈的先人一样，灰烬触摸初火，点燃了自己，成为了新一代的薪王。但火焰并没有如预想般熊熊燃起，仍然在静静的流逝。昏暗中，灰烬的背影是那么落寞，因为这不过是另一个被诅咒的传火之旅的开端。
防火女捧起篝火中的火焰，让它在怀中慢慢燃尽。世界渐渐归于黑暗，火的时代正式落幕。但这并不是一切的终结。对于世界来说，只是离开了扭曲的火之时代，进入了一场更大的轮回。也许在某一天火焰还会燃起。
在尤莉雅带领的黑暗教众的簇拥下，灰烬把初火吸入体内。他将利用火的力量带领游魂们开创一个属于不死人的黑暗时代。
在灭火结局的中途，灰烬偷袭了怀捧初火的防火女，并将火焰占为己有，至于世界是否会因此毁灭还是会如何，他并不关心。正如旁白讲述的那样，“灰烬渴求余火”，灰烬只要得到火焰的温暖就足够了。
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